AvrDude ist ein Programm zum übertragen des übersetzen Mikrokopter-Quellcodes auf die FlightCtrl (flashen). Alternative zu AvrDude ist PonyProg

Unter Windows besitzt das KopterTool eine grafische Schnittstelle für AvrDude, mit der man bequem den Mikrokopter flashen kann. Unter Linux kann man folgende Befehle benutzen, um die FlightCtrl zu flashen: